1.3系の仮想サーバー化からシングルでもマルチ寄りに挙動が変化したり
1.9のコンバットアップデートでは戦闘に関わる挙動が変えられたりしてる

MODでは定番の一角だったIC2が開発チームの頭が抜けてからずっとExperimental仕様で迷走気味の一方GregTechが爆走
RedPowerは作者が飽きて更新が止まり大量のサルベージや派生が登場
エネルギー系統はBuildCraftのMineJouleから後発のThermalExpansionで扱うRedstoneFluxにほぼ統一
その他にも機能性ブロックを組み合わせるタイプのMODは新作が増えてきて多様化した

Minecraftじゃなくなるレベルの変革を求めるなら無数にあるフォロワーを探せばいいんじゃないかな