拡張編集でflvファイルを読み込んだ時、Creating Index File...5%と読み込み100%になった後

Ismashinput
[Warning]:Detected PTS 8620729 duplication at frame 258312

って数回出る。OKを押したら編集はできるようになるんだけど

flvファイルを読み込んで分割後いらない部分を削除、残っている部分に合わせて確認しようとするとまた同じように

Ismashinput〜が出る。
OK押せばまた編集はできるけど分割と削除をたくさんするからすごく時間がかかる。
フレーム数32000でやってるのがいけないのかと思い
最大フレーム数8388607で設定してみても同じように出た。

分割しただけで一部を削除さえしなければこの表示がでる事はない。
あとMP4だと読み込みや分割で[Warning]:Detected PTS〜は全くでる事もなく問題ない。

flvファイルの時に出るんだけどこれは何が原因？
メディア情報　http://i.imgur.com/3h5uZzn.jpg

Aviutl 環境設定：
コーデックの設定 http://i.imgur.com/Xf8TePW.jpg
入力プラグインの優先度 http://i.imgur.com/uBenTOa.jpg
システムの設定 http://i.imgur.com/u0XV2Im.jpg

それからたまにこんなエラーも出る。これが出たらプログラム終了させる道しか残ってない。

Application exception
アドレス"0x77cfe3fe"で例外"0xc0000005"が発生しました
発生モジュール：ntdll.dll
オフセットアドレス：0x0002effe
備考：INPUT_PLUGIN_TABLE：：func_close()[directShow File Reader]

正常な動作が出来ない可能性がありますが処理を継続しますか？

解決方法があればお願いします。