AviSynthが使いたかったのですが導入の時点で詰みまして
結局ffmpegでFFV1出力したら、出だしだけズレてる速度正常ファイルができたのでそれ使いました。
VLCだったら一番簡単にできたのですが、可逆が選べないのと、時間指定が始点しかできないのでダメですね。