>>308
察しの通り、カットしたせい。

拡張編集を使うのであれば、全て拡張編集で済ませること。
カットも拡張編集で出来る。
本体側の機能は原則的に使うな。

書き込み内容から察するに、元動画ファイルをAviUtl本体に読み込んでいるだろ。
その時点で間違いだ