IE6の場合

ツール インターネットオプション 設定 ファイルの移動

でいけるんじゃない?
俺はそれでフォルダをC:\からD:\へ移動させた記憶があるようなないような・・・

上手く行かなくても責任は取れませんので、もしやってみるなら、
移動前のフォルダの場所をメモしておいて元に戻せるようにしておくとか
事前にググって確認するとか自己対策してからにしてください