>>642
鯖側から・・・の言いたい意味がわかったよ・・・要するに一般的なQueue機能のことで正解。
それは>>638で出したソフトはみんなできるよ。
他にも海外のソフトだといろいろ出来るのが多いから、
おそれずにひたすら試して数をこなすことをオススメする。
相性みたいなモノがあるから（w

>>645
たぶん鯖側でNOOPを無視する設定になっているんでしょう。
なので、NOOP以外のコマンドを送信すればよいと思いますよ。
たとえば、RootFTPならNOOP発行の代わりにPWD発行に変えるとか。
BPFTP鯖みたいに設定次第でNOOPを無視する鯖にもコレで対応できます。
FTPVoyagerならオプション設定のKeepAliveでNOOP以外にPWDも送信できるように
するチェックボックスがありますね・・・