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読んde!!ココには出力時の画像dpiを指定するところがあります。
[オプション]-[環境設定]-[画像領域の設定]-[画像の出力解像度]です。
72,96,150,200dpi、元のままの5つから選択できます。

読んde!!ココしか使ってないので、他のOCRではどうだかは知らないです。