>>414
その記事は古いFirefox Syncサービスについて書いたものと思われます
現在のFirefox Syncではそこに書かれていることはできません

>>412-413
あなたのやりたいことを整理します
(1) とりあえずMac上のFirefox環境からブックマークを全消去したい
(2) Firefox Syncのサーバ上のブックマーク情報もリセットして仕切りなおしたい
ということだと理解しましたがそれでいいでしょうか?

(1) ですが、作業は必ず Firefox Sync を切断してやってください
とりあえずプロファイルはバックアップ取っておいて、places.sqlite ファイルを削除しちゃえば
ブックマークや履歴など全消去になります(もちろんFirefox終了して削除です)
Firefox起動して確認してみてください
そして履歴とブックマークの管理を開いて、バックアップを作成しておいてください

次に (2) ですが、自分でテストしたわけではないのであくまで参考に
Firefox Sync を接続(他の端末は繋がない)して同期が行われ
ブックマークが復活しなければOKです
もし復活するようなら Sync 状態でバックアップから復元してみたらみたらどうでしょう

同期は1つの環境を「主」、他を「従」と決めてやることが大事です
そして複数の同期サービスを使えば当然混乱します
Windows側を従とするならば、いったん空のプロファイルとして同期をやり直したほうがいいでしょう