https://trac.ffmpeg.org/wiki/Seeking#Cuttingsmallsections

-ss 00:01:00 -i video.mp4 の場合
入力ファイルの1分の所を、00:00:00（タイムスタンプのリセット）として
その後の作業(エンコードなりカットなり)をする

-i video.mp4 -ss 00:01:00 の場合
入力ファイルの1分の所を、00:01:00としたまま
その後の作業(エンコードなりカットなり)をする

作業中のファイルの時間の目印のことでしょ
あなた方々で見かけるわね・・・