ここの書き込み参考にしてPPAPIに切り替えたら、aero切っててもニコニコのプレイヤーが暗転しなくなったし、FC2のプレイヤーが点滅して音量のスライダーに触れないのも直ったわ
まじサンクス
ちなみにchromeから持ってくるのめんどかったから、http://get.adobe.com/jp/flashplayer/の「別のコンピュータの Flash Player が必要な場合」ってとこから直接落とした
んで、C:\Windows\System32\Macromed\Flashにいっしょにインストールされたわ。最初どこにされたのか分かんなくて焦った