もうずいぶん前にオプションから「Manage URL list for IE tabs」っていう項目がなくなっていますが、どこで設定を保持してるんだろう?
最近のバージョンだと、いったんIEモードに切り替えると親ドメインごとIEモード固定になるから使いづらい・・・