家の場合だけど、

ちょっと前のβ版からCoolNovoを終了させてもプロセスが1つ残ることが多くなってて、
その状態で起動すると多重起動状態になってた。

それに気づいた理由は、ClLaunchから多重起動させない設定で起動することが多く、
プロセスに残っている状態だと起動してくれない事がよくあったため。

で、今回はプロセスが残ってると多重起動せずにダイアログが出るようになった…のではと推測。
タスクマネージャーでプロセス終了させれば、家では普通に起動するようになるので。