結局、>>89>>99の方が言っているような方法は無理でした。
というのもディスク管理でDドライブのレター番号を変更できなかったからです。
つまりDDもエクスプローラコピーでもダメでした。

そういうわけで>>97の方法でやりましたがやはりクローン後にディスク2とクローン先のSSDの
両方を接続したままではSSDがDドライブとしては認識しなかったです。

なのでディスク2を外してクローン先のSSDを接続した状態で起動し、ディスク2は起動後に
USB接続してディスク2内の旧Dドライブを削除し、退避していたEのデータを戻すことにします。

ともあれアライメントも調整したままクローンできたのでとりあえず完了できて感謝します。