2つのstyelsheet定義等をnsIXULAppInfoで分岐させるように処理したら上手くいきました。
重ねて質問なのですが、nsIXULAppInfoの分岐を1つのstylesheet定義(var style1 = <![CDATA[ ... ]]>.toString();)の途中に書くことは可能なんでしょうか？
↓みたいなイメージです
var style = <![CDATA[ if (versioncheck) { #FindToolbar{max-width:200px} }else{#FindToolbar{max-width:300px}} ... >.toString();