＞PC再インスコしたら設定も拡張も全部無くなってた…
っていうのはＯＳごと入れなおしたってこと？それともIronを更新したってこと？

portable版だと更新する時はProfileを上書きしないでやるべきだそうだ

いいえ拡張も同期に対応しています