プロファイルがDefaultの一つしかない状態で、直接 chrome://newprofile を開いて
[キャンセル] をクリックすると、強制終了されてブックマークが全消去されてしまう
うっかり開いてしまったらそのまま [作成] をクリックするか、そのタブを閉じれば回避できる