>>936
Windows向けバイナリをWindows上でビルドしたいってこと?
やっぱり、Windowsバイナリを配布してるZeranoe さんのところのビルドオプションとかが参考になるんじゃないかな
http://ffmpeg.zeranoe.com/builds/

特別な理由がなければ、linux上でやったほうが必要なライブラリとか
パッケージマネージャで拾ってコれるし何かと便利だと思うよ