あ、訂正。

ffmpeg -f avi -vcodec copy -an -map 0.0:0.0 -i "test3d 0to.AVI" -f wav -acodec copy -i "test3d_oto.wav" -f avi out.avi -newaudio -map 1.0:0.1 -newvideo -map 0.2:0.2

ま、どっちでも、動くんだけど・・・。