そういえば6u30をつっこんで最初にIE9を起動したときに
「プラグインが追加されたけど有効にするか」みたいなことを聞かれましたね

特に何も考えずはいと答えましたが
多分そこでキャンセルすると
Java Plug-in SSV Helperの方は無効になっていたのでしょう