>>547の質問者です。

つまりUTF7読み込み対応なら正常に表示できるのに、RC11でUTF8に切り替えた
としたなら、このタイミングでShift-JISが読めなくなった可能性大です。
RC10でギリシャ文字検索に対応し、RC11でその検索不具合のFIXが入っている
のでなんか臭いですね。
試しに秀丸でUTF8で修正保存して0.9.0で読んだら、、ビンゴ！でした。
多言語対応強化でFreeMind 0.9.0 RC11でUTF7を捨てたことは間違いなさそう
です。リリースノートには書いてないけど、、、
結局、Androidからの出力がUTF8だからダメなのではなく、UTF8じゃないから
だめだということになりそうです。
バグ報告として送ってみます。（使おう会でいいのかな？）
お相手いただきありがとうございました。