小出しになって申し訳ないのですが現状このような状態です。
例） temp.txt→temp.txt.bakとリネームするとして「$/.bak」、「/$/.bak」といった正規表現を使用。

1.21 先頭に/なし、先頭に/ありともにtemp.txt→temp.txt.bakと正常にリネームされる

1.22で先頭に/なし 「RegExp: Bad command or Not found src'/'replace」というエラーメッセージ
1.22で先頭に/あり temp.txt→temp.txt.bakと正常にリネームされる

1.22+1で先頭に/なし 「RegExp: Bad command or Not found src'/'replace」というエラーメッセージ
1.22+1で先頭に/あり temp.txt→temp.txtとなり同名ファイルがあるときと同じ挙動

環境はWindowsXP SP3、PPxはそれぞれ32bitユニコード版、正規表現ライブラリはbregonig.dll Ver.2.0.4です。