Windows 7 はインストール時に"システムで予約済み"という隠しパーティションを作成します。
このパーティションは BitLocker ドライブ暗号化で使用される他に、オペレーティングシステムの起動に必要なファイルが含まれています。Windows 7がインストールされた環境をバックアップする際は、
必ずこの隠しパーティションとシステムパーティションを一緒に指定してバックアップを作成してください。
隠しパーティションを含めずにシステムパーティションのみのバックアップを作成し復元した場合やパーティションの位置を変更してしまった場合、オペレーティングシステムが起動できなくなる可能性があります。

とありますが復元する際にＣドライブと１００Ｍの予約領域を選択した結果起動できなくなってしまいました。

ＨＤＤのパーティションも若干変更されてしまって２４Ｍほどの未使用領域も作られてしまいました。

クリーンインストールするしかないのでしょうか？