windowの形についてはパフォーマンスはどちらも同じ。
ほぼ見掛けだけの問題。

サーバOSで何ぞ？
XP64bitか2003Serverかって話しなら、余計なプロセスが上ってないXPの方
むしろ軽いんじゃない？サービス落として同じ条件にしたら同じだと思.
カーネルのバージョンはどちらも同じだし。
この辺は何をさせたいかにもよるので一概には言えん。
3Dゲームやりたいなら、vistaか7とかいう話しになるし。

windowsホストとlinuxホストならwindowsの方が少しだけ早いらしいが、
俺は調べてないからどこがどう早いのかは分からない。