今比較検証中なんだが、なんだか妙なことに気付いたので途中報告。
とりあえず3.98.2と3.98.3で、このスレに出てたオプションコマンド付きでエンコして比べてたんだが、
出音は違うことは違う模様。

ただこれが曲者で、ある範囲だけ抽出して波形を目で比較すると、
「違う部分」と「同じ部分」が出てくる。
バイナリを比較しても、これまたしばらく「違う部分」が出てきたかと思いきや、
「同じ部分」が間で出てきたりする。
つまり、何か特定の場合のみスイッチの入る処理の仕方が変わったっぽい。

つづく。