WebKit Nightly Rev.48794 で、Safari 4 初回起動時の文字化けが直ってるね↓
http://www1.axfc.net/uploader/Img/so/60544.png

↑久々に、文字化けしてない Safari の初回起動ウィンドウを見たんで記念撮影w
あと、Rev.48794 では localizedStrings.js も変更されてるんで、その変更内容↓

・206 行目 (末尾) に追加↓　※行末での改行なし
localizedStrings["(unable to decode value)"] = "(unable to decode value)";

んで、↑を「（値をデコードできません）」と訳して >>25 のヤツに追記したのが↓

ja.lproj-localizedStrings.js-MOD-48794.zip (オリジナル)
http://www1.axfc.net/uploader/File/so/31564.zip