ずいぶん面倒なことをやってるんだな。

俺はMBRにフリーソフト「MBM」を組み込んで、それぞれの領域のboot.iniには
自分自身しか記載しないようにしてる。
これで、どこの領域に展開しても常に同じだし、余計なトラブルは皆無だな。

>>745の件は、どっちが悪いかと言えば確実にTIが悪いのだが、
Acronis製品は不具合が潰されるのが遅くて定番だから、自分で対処した方が早いよ