違いますよ。

同じバックアップポイントの
「完全」「増分」「差分」どれから復元しても同じ状態に戻らなければおかしいでしょ。
無いはずのファイルがあったり有るはずのファイルがなかったりすると
その整合性の保証は誰がするの？ってことになる。

話はもっと単純で「完全」「増分」「差分」の違いは
バックアップ方法の違いだけですよってこと。