>>105のマルチパネルにGM使えるようにするスクリプトなんですが、
たとえば
document.body.innerHTML = document.body.innerHTML.replace(/foo/g, 'bar');
のような文字列置き換えスクリプトを適用したいときはどうすればいいんでしょう？

GMForWebPanels.uc.jsの最後や(function(){})();内の最後に追加したり、
新しいGMスクリプトを作ってそこで実行してもマルチパネル内のfooがbarに置き換わったりはしません
スクリプトの指定範囲が問題かと思ってchrome://browser/content/web-panels.xulから*にしてみても駄目

自分の知識ではこのスクリプトが何をしてるか正確に分かってなくて、
何か本質的に間違ってるのかもしれませんけど