以前あった、JREのバグが再発しているね。
JREをインストールするたび、SeaMonkeyのprefs.jsが破壊される。
(Version 6 Update 6でも、Update 7でも、Update 11でも、破壊された)

Bugzilla-jp - Bug 3004
JRE Windows 版のインストーラーが Mozilla の prefs.js に文法エラーを作る
ttp://bugzilla.mozilla.gr.jp/show_bug.cgi?id=3004