携帯プレーヤーとの相性って、waveの段階の話じゃね?
相性に合わせてDSPなどで調整したwaveをlameでエンコでしょ。
foobarなら、DSP処理とエンコを一括で出来るよ。

lameはソースのwaveに忠実なエンコしてくれればいいよ
携帯プレーヤーの相性に合わせて変に脚色されたら、逆に困るがな