俺のミスがあった。
"-no-remote" オプションつきで最初のFirefoxを起動してましたサーセンｗｗｗ

参考：
> ただし, -no-remote 付きで起動されたものに対しては, 外部からリンクを渡してそれを開くことができない。
> 従って, このような使い方をしていて, かつ外部からリンクを渡してそれを開きたい場合は,
> どれか一つは -no-remote無しである必要がある。
プロファイル - Mozilla Firefox まとめサイト
http://firefox.geckodev.org/index.php?%E3%83%97%E3%83%AD%E3%83%95%E3%82%A1%E3%82%A4%E3%83%AB


アップデートはしてます。
基本、FirefoxPortable.exeの方を使わず、--profile指定で起動してるので、
自動アップデートは問題ないみたいです。今は 3.0.8です。

ああ、それで、Janeのコマンドから >>387 を指定(FirefoxPortable.exe経由で)して
再度やってみているのですが、新しくウインドウが開いてしまって困ってます。
既存のウインドウの新しいタブとして開きたいんだけど、もしかしたらそもそもできないのかな…
プロファイル自体は既存の立ち上げているのを使ってくれているのですが…。