Macだけど、OmniGraffle（Win-Visioみたいなアプリ）でいいや。
アウトラインビューで、アウトラインとマインドマップが同時に使えるし、
その後に好きなように配置変えたり、線や図形を調整したり、表入れたりできる。
http://www.omnigroup.com/applications/OmniGraffle/
http://www.act2.com/products/omni/omni_graffle5/