僕の環境ではホストXP、ゲスト98SEだけど
1920×1440に設定してちゃんと32ビット色設定できてる。
AutoFitGuestで自由なサイズにもできてる。
最小は696×488みたい。
1199×485とかでもちゃんと表示される。
どこも変じゃない。

しっかり動くんだけど、Direct3Dは動かない。
Direct3Dが目的なら、VMware+Windows98では動かないから。

2003年ごろのHPでは一部動くって書いてる人もいたけど。
多分問題は、色を自由に変更できないことじゃないかな。
16〜16ビットまで全部動かないとDirect3Dはテストに合格しない。
少なくとも16ビットじゃないとゲームが対応してないし。