>>956の件ですが、バックアップが止まる条件は
"FTPで落としたcgiファイル、またはそのフォルダ"
ということで特定できました。

そのファイルを消してもまた別のcgiファイルで止まります。
失敗メッセージを上げて終了せずに、何十分待ってもそこで止まったままになる形です。
権限が設定されているせいかもしれません。

HPで自作、または頂きもののcgiを扱っていて
一度上げたものをローカルにバックアップする人は注意が必要かも。
あまり解決になっていませんが、フォルダごとlzh等で圧縮してしまうことで回避し
無事バックアップは終了しました。
(もちろん元ファイルは消す)

同じ症状が出た方がいたときのために書き残しておきます。

>>957
終わりません