9からのバージョンうpなので、10の時のAHCI認識状況について、具体的には経験していないから分からない。
その前提だけど、M/BをAHCI設定したままでブータブルメディアから起動し、完全版でHDDを認識。
認識したHDDに対して、イメージ作成まで確認。寝る。

ASUS P5K-E P35(ICH9R)
P7K500 WD5000AACS (AHCI)
WindowsXP SP2