ハイライトの黄色の奴は
userContent.cssに
#__firefox-findbar-search-id,
.__mozilla-findbar-search {
  color: 文字色 !important;
  background-color: 背景色 !important;
}
で変更できる筈。

選択ハイライトの緑のは……
>>586なのかな。明日にでも調べてみる。