>>444
＞AAC VBRにしようとしたら、いきなりエンコ一曲目(システムオブアダウン prison song)で
＞音飛び(イントロの途中で次の曲に㌧でしまう)した。

これが本当ならかなり貴重でかつ重要な情報だと思います。
iTunes AAC VBR のビットレートはどれくらいにしましたか？
ttp://www.hydrogenaudio.org/forums/index.php?showtopic=36935&view=findpost&p=326853
には iTunes 5 AAC VBR 256kbps で音跳びが発生したが 192kbps なら大丈夫という話がある。

可能ならばエンコードすると音跳びする圧縮前の30秒未満のサンプル音源
とエンコード結果の m4a ファイルの両方を
http://rapidshare.de/ あたりにアップロードして公開した方が良いと思います。