ありがとうございます。長文失礼いたします。
XC_acsrを、0,1とも試してみましたが、特に変化はないようです。
どうも短時間にフォルダ間を行き来すると発生することが多い気がします。
ちょっと分からないのですが、キャッシュの更新中？か何かのタイミングでしょうか？
カーソル位置が先頭になる場合と、ファイル表示順が狂う場合があります。
後者は、属性を無視してアルファベット順に並んでいるようです。
(SMB経由NTFS)(PPcの表示順設定でreadonly等は先頭に表示指定)
全ファイルの表示色が、新規追加？になります。[.]で更新すると正常順序に戻ります。
フォルダが空と認識した後、存在するファイルを追加認識したような動作に見えます。
カーソル位置のみ初期化される場合は、これは起きません。

フォルダを開く場合の速度ですが、キャッシュファイルがあるドライブは重くないので、
別の処理の完了待ちをしているように？感じます。
難しい部分は分からないのですが、dosでdirが遅いというより、cdが遅い感じです。
dirの部分はキャッシュから読み込んでいるようで、ファイルが多いとcache表示が出ます。

あと別件なのですが、samba先でreadonlyを付けたファイルをPPcの*fileでmoveすると、
同一ドライブ間でのmoveではなくcopy && rmの処理になります。
explorerやPPc内蔵のmove以外では瞬時処理されます。