j2ch.jarを解凍するとskins/defaultってフォルダがあるから
そのdefaultフォルダを丸ごとcopyしてどこかに保存する（仮にmyskinと名付ける）

その中の"threadList.css"でスレ一覧の見た目を設定できる
（レス画面なら"articleList.css"　板一覧なら"boardList.j2sp"）

"threadList.css"の2行目
"body { margin:5px; color:#000000; background-color:#ffffff; width:94%; }"
の"#ffffff"が背景色なので好きな色に変える

変更後のmyskinフォルダを\j2chインストールフォルダ\adm\skins\以下にcopyする

ブラウザでj2chを開く→各種設定→スキン(*):でmyskinを選択する