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Q.シンプルステレオ(SS)とジョイントステレオ(JS)、どっちが良いの?
A.一長一短です。
  JSはSSに比べて音そのものは綺麗になりますが、ステレオ感などの面で音に影響を与えます。
  SSにはそういった面での影響はありませんが、JSに比べるとレート不足により音質が落ちます。
  結局のところあなたがどちらを重視するか次第です。気になるならば聞き比べて判断しましょう。
  一般的には低レートではJS、高レートではSSが採用されています。
  なお、プリセットではレート毎にJSのSSとMSの比を最適に調整してあるので、比較的問題は出にくいようです。
  また、一般的にはステレオ感の損失を気にする人は少数派のようです。