>>559
> これでTeXを文字コードUTF-8で書けると思ったのですが
> UTF-16のみでがっくりきました。

UTF16で書かれたものがコンパイルできるわけでもなく（為念）

> 文字コードにUTF-8を指定できるTeX、
> または簡単に複数のファイルを一括してUTF-8 ⇔ UTF-16に
> 変換できるTeXを探しています。

使った事がないので外しているかもしれませんが：
LaTeXならCJKパッケージはどうでしょうか？
Omegaも使えるのではないでしょうか？
pLaTeXの枠組みでは無理でしょう