グロッケン、オルガン、打楽器系は倍音の方が大きい場合が良くあるよ。
倍音の組み合わせで存在しない基音が聞こえることもある(人間の耳の特性?)。
単音を変換するなら後で人間がトランスポーズさせてあげればいいのかも知れないけど。