アプリケーション名＋ユーザー名.INIで管理したらどう？
レジストリはユーザーごとに用意する必要がなくなって
ユーザーの参照くらいになると思うけど。
インストール後の再起動でレジストリのエラーになると
古いレジストリで更新情報が行方不明になるから
INIのほうがありがたいんだわ。