＞次にいつどんなファイルが 消されるか
何者か（人でもプログラムでも）に「消された」んじゃなく、
十中八九は誤って「消した」んだと思う。自分で。無意識かどうかはともかく。

そのまま使い続けても問題ないとは思うが、
再インスコした方が精神的に安心だと思う。

…って、パソコンの相談じゃなく精神的なカウンセリングみたいだな。