SSLなら途中の経路は安全だけど
送られたデータの保管のしかたが間抜けなら、そこから漏れる。
そういう例は↓のスレでよく出てくる。
http://pc.2ch.net/test/read.cgi/sec/1026067575/l50

というわけで100%の安全はない。
でも考えてみればネット上じゃなくても危険はあるわけで
(店の奥のあなたの目の届かない所にカードを持っていってインチキする店とか)、
ネット上だからといってあまり神経質になる必要もない。
悪用されていないか、明細を毎月キチンとチェックすればいいだけのこと。