じゃあ特殊な紙だからとかじゃなくて、機器の問題だよね。
とりあえず白黒画像じゃなく、グレースケール画像でやってみたらどうかな？
OSとスキャン方法とかスキャンに使うソフト名を書いとけば
解決するかもしれないよ
自分は寝るけど。ごめん。