左上のアイコン（ｱﾌﾟﾘｹｰｼｮﾝﾎﾞﾀﾝ）をクリックして「オプション」を選べば
基本設定で簡単に指定できるわけだが。
ちなみに俺はD:\Users\Documents\ScanSnap\にしている。