CMYKの色を載せる順番が気になるなら、
原稿を4色分解して特色印刷で1色ずつ載せて行けば良いんじゃね
1色刷った後、排出せずに用紙保持したまま再印刷できたはず
手持ちのMD5000は壊れたので確認できんが