エプソンのフラベはepsonscanで管理しているから
機種が違っても大体同じ使い方だと思って回答しますと、
epsonscanにはサイズ自動検知あります
ただし、毎回プレビューでチェック入れる必要あるので結果的に2度スキャンする必要があります
なので、取り合えず保存して後からトリミングした方が良いと思いますね
※写真など4枚を一度にセットしての自動切り取でしたら自動でやってくれます