俺もS1500とXPで、読み取り終わったらファイルが消えていた
という経験を何度かしたが、後でよく見たら
自分で設定した筈の保存フォルダが、SS側のデフォのフォルダに
勝手に変更されていた、というオチだった。
毎回ではないから発見するのに時間がかかったw